Investigation of Genetic Diversity and Paternity in Kangal White Karaman Rams Using Microsatellite Markers = Kangal Akkaraman Koçlarında Genetik Çeşitlilik ve Ebeveyn Testinin Uygulanabilirliğinin Mikrosatellit Belirteçler Kullanılarak Araştırılması

Bu çalışmanın amacı, Kangal Akkaraman Koyunu ıslah projesi kapsamında, populasyon seviyesinde genetik çeşitliliğin tespiti ve DNA seviyesinde ebeveyn tayininin olasılığının araştırılmasıdır. Pilot bir çalışma olarak, kapalı ve kan yakınlığı değerlerinin yüksek olduğu tahmin edilen iki Kangal Akkaraman Koyunu sürüsünde damızlık olarak kullanılan toplam 13 koçtan kan örnekleri alınmıştır. Toplam 20 mikrosatellit lokusu kullanılarak polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile spesifik genom bölgeleri çoğaltılmıştır. PZR ürünleri kapiller elekroforez ile ayrıştırılarak allel ve genotipleri belirlenmiştir. Toplam 99 farklı allelin gözlendiği bu çalışmada, allel sayıları farklı lokuslar için 1 ile 8 arasında değişmektedir. Gözlenen heterezigotluk (Ho), beklenen heterezigotluk (He) ve polimorfizm bilgi içeriği (PIC) değerlerinin sırasıyla 0.000 - 0.923, 0.000 - 0.871 ve 0.000 - 0.818 arasında değiştiği gözlenmiştir. Kullanılan 20 lokus ile toplam Dışlama Gücü (DG) değeri 0.999975 olarak bulunmuştur. Enformatif 12 lokusun kullanılması ile oluşturulacak DNA test panelinin toplam DG değerinin 0.999828 olacağı ve bu panelin Kangal Akkaraman koyun sürülerinin ebeveyn tayini çalışmalarında başarıyla kullanılabileceği kanısına varılmıştır. -

Anahtar sözcükler: Genetik çeşitlilik, Ebeveyn tayini, Kangal Akkaraman koyunu, Mikrosatellit =



The objectives of this study were to estimate genetic diversity and test possibility of conducting paternity testing at the DNA level as part of a breeding project of Kangal White Karaman sheep. As a pilot study, blood samples were collected from 13 rams that were used for breeding purposes in two different flocks in which level of inbreeding is proposed to be high. A total of 20 microsatellite markers were used to amplify genomic DNA by polymerase chain reaction (PCR). The resulting PCR products were separated by capillary electrophoresis and allele genotypes were determined. A total of 99 different alleles were determined ranging from 1 to 8 at each locus. The observed (Ho) and expected heterozygosities (He) values were ranged from 0.000 to 0.923 and from 0.000 to 0.871, respectively. Polymorphism information content (PIC) values were between 0.000 and 0.818. Total power of exclusion (PE) value was calculated as 0.999975 for twenty loci. Our results suggested that a panel, including the most informative twelve loci provides a total PE value of 0.999828, can be useful for parentage testing in Kangal White Karaman sheep. –

Keywords: Genetic diversity, Paternity testing, Kangal White Karaman sheep, Microsatellite