В статье представлена усовершенствованная методика оценки защищенности подземных вод от загрязнения за счет поверхностных источников. Даны обоснования и новые предложения по выделению категорий и уровней защищенности подземных вод для горно-складчатых областей. Приводится пример оценки защищенности подземных вод в пределах интенсивно осваиваемой северо-западной части Иссык-Кульской впадины Кыргызской Республики.